Protein–RNA interactions for Protein: Q99N07

Ms4a6d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6D, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6dQ99N07 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a6dQ99N07 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a6dQ99N07 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a6dQ99N07 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a6dQ99N07 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a6dQ99N07 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a6dQ99N07 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a6dQ99N07 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a6dQ99N07 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ms4a6dQ99N07 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ms4a6dQ99N07 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms