Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tdrd1Q99MV1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd1Q99MV1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd1Q99MV1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms