Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PtprtQ99M80 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC31.91■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
PtprtQ99M80 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
PtprtQ99M80 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PtprtQ99M80 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
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