Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chmp1b1Q99LU0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Chmp1b1Q99LU0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms