Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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