Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
EtfaQ99LC5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
EtfaQ99LC5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
EtfaQ99LC5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms