Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pagr1aQ99L02 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pagr1aQ99L02 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Pagr1aQ99L02 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pagr1aQ99L02 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms