Protein–RNA interactions for Protein: Q99K23

Ufsp2, Ufm1-specific protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp2Q99K23 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ufsp2Q99K23 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ufsp2Q99K23 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.6 ms