Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX4

Eif3m, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit M, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3mQ99JX4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Eif3mQ99JX4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Eif3mQ99JX4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms