Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Kdelr1Q99JH8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Kdelr1Q99JH8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Kdelr1Q99JH8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.1 ms