Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
SptssbQ925E8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
SptssbQ925E8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms