Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sf3b3Q921M3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Sf3b3Q921M3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sf3b3Q921M3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms