Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sh3bp4Q921I6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Sh3bp4Q921I6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Sh3bp4Q921I6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms