Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Med28Q920D3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Med28Q920D3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms