Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca5Q91ZW3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smarca5Q91ZW3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smarca5Q91ZW3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms