Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Pde6cQ91ZQ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
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Pde6cQ91ZQ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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Pde6cQ91ZQ1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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Pde6cQ91ZQ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pde6cQ91ZQ1 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Pde6cQ91ZQ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Pde6cQ91ZQ1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pde6cQ91ZQ1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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