Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atl3Q91YH5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atl3Q91YH5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atl3Q91YH5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms