Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Trpm2Q91YD4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Trpm2Q91YD4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Trpm2Q91YD4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Trpm2Q91YD4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm2Q91YD4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm2Q91YD4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm2Q91YD4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm2Q91YD4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm2Q91YD4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Trpm2Q91YD4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms