Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trub2Q91WG3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trub2Q91WG3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trub2Q91WG3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms