Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Snx15Q91WE1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Snx15Q91WE1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms