Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Csde1Q91W50 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Csde1Q91W50 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Csde1Q91W50 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms