Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Snx9Q91VH2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx9Q91VH2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx9Q91VH2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms