Protein–RNA interactions for Protein: Q91VF6

Col26a1, Collagen alpha-1(XXVI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col26a1Q91VF6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col26a1Q91VF6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col26a1Q91VF6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col26a1Q91VF6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 155.1 ms