Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ppargc1bQ8VHJ7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ppargc1bQ8VHJ7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms