Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP3

Mical1, [F-actin]-monooxygenase MICAL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mical1Q8VDP3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mical1Q8VDP3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mical1Q8VDP3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mical1Q8VDP3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms