Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDD8

Washc1, WASH complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc1Q8VDD8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Washc1Q8VDD8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Washc1Q8VDD8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Washc1Q8VDD8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms