Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Dnajc28Q8VCE1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dnajc28Q8VCE1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dnajc28Q8VCE1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms