Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT2

Sds, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdsQ8VBT2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SdsQ8VBT2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SdsQ8VBT2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SdsQ8VBT2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SdsQ8VBT2 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms