Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trim29Q8R2Q0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trim29Q8R2Q0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trim29Q8R2Q0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms