Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Vmn1r200Q8R281 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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Vmn1r200Q8R281 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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Vmn1r200Q8R281 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Vmn1r200Q8R281 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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Vmn1r200Q8R281 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Vmn1r200Q8R281 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Vmn1r200Q8R281 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Vmn1r200Q8R281 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Vmn1r200Q8R281 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Vmn1r200Q8R281 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vmn1r200Q8R281 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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