Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Sumf1Q8R0F3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sumf1Q8R0F3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sumf1Q8R0F3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sumf1Q8R0F3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sumf1Q8R0F3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sumf1Q8R0F3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms