Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A6

Vstm2a, V-set and transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2aQ8R0A6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Vstm2aQ8R0A6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2aQ8R0A6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms