Protein–RNA interactions for Protein: Q8K402

Tbx22, T-box transcription factor TBX22, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx22Q8K402 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tbx22Q8K402 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbx22Q8K402 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbx22Q8K402 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms