Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Matr3Q8K310 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Matr3Q8K310 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Matr3Q8K310 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms