Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Depp1Q8K2F3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Depp1Q8K2F3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.9 ms