Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Mtmr3Q8K296 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Mtmr3Q8K296 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Mtmr3Q8K296 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms