Protein–RNA interactions for Protein: Q8K249

Cd300e, CMRF35-like molecule 2, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300eQ8K249 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300eQ8K249 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cd300eQ8K249 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd300eQ8K249 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd300eQ8K249 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd300eQ8K249 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd300eQ8K249 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cd300eQ8K249 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.4 ms