Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim68Q8K243 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim68Q8K243 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim68Q8K243 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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