Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Sde2Q8K1J5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sde2Q8K1J5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sde2Q8K1J5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms