Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FgbQ8K0E8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FgbQ8K0E8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FgbQ8K0E8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
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