Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIN6

Celf3, CUGBP Elav-like family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf3Q8CIN6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Celf3Q8CIN6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Celf3Q8CIN6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Celf3Q8CIN6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.7 ms