Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHT1

Ngef, Ephexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgefQ8CHT1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NgefQ8CHT1 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NgefQ8CHT1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NgefQ8CHT1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms