Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snx8Q8CFD4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snx8Q8CFD4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms