Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc178Q8CDV0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc178Q8CDV0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc178Q8CDV0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms