Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prpf31Q8CCF0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prpf31Q8CCF0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.8 ms