Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7D2

Crbn, Protein cereblon, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrbnQ8C7D2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CrbnQ8C7D2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CrbnQ8C7D2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CrbnQ8C7D2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms