Protein–RNA interactions for Protein: Q8C708

Transmembrane protein C16orf54 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8C708 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8C708 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C708 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C708 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C708 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C708 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C708 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C708 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C708 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q8C708 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8C708 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8C708 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8C708 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q8C708 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C708 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C708 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C708 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C708 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C708 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C708 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C708 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q8C708 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q8C708 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C708 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C708 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C708 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C708 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C708 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C708 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C708 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q8C708 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q8C708 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q8C708 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C708 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C708 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C708 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q8C708 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8C708 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8C708 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8C708 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8C708 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8C708 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8C708 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8C708 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8C708 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q8C708 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8C708 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8C708 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8C708 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8C708 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8C708 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8C708 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8C708 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8C708 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q8C708 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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