Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6E0

Cfap36, Cilia- and flagella-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap36Q8C6E0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cfap36Q8C6E0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cfap36Q8C6E0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cfap36Q8C6E0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap36Q8C6E0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap36Q8C6E0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap36Q8C6E0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap36Q8C6E0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap36Q8C6E0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cfap36Q8C6E0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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