Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf428Q8C1M2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Znf428Q8C1M2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Znf428Q8C1M2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Znf428Q8C1M2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
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