Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0R0

Usp37, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 37, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp37Q8C0R0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp37Q8C0R0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp37Q8C0R0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Usp37Q8C0R0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108 ms